禅悦寺建于宋元祐二年(1087),初名施水院,靖康二年(1127)请到『禅悦寺』匾额。宋《澉水志》载,禅悦寺为澉浦寺庙之首。明《续澉水志》又载,禅悦寺,居『天下十刹之数』。有山门、前殿(金刚殿)、正殿(大雄宝殿)、后殿(观音殿)及钟楼。其时,钟楼高三丈。
元代,宣慰使杨梓用日本进口铜铸成一口重达5480斤的大钟,并于禅悦寺内建成高达六丈钟楼悬挂,声闻数十里,民间称为神钟。
明洪武三年,寺内增建方丈堂,各殿之间用厢房(斋堂)相连,寺后修后花园,开挖大寺河,成为一个园林式建筑群。
明嘉靖初,寺毁于火,仅存钟楼。明万历六年,飓风,钟楼倒。万历三十二年,重建禅悦寺。三十八年重建钟楼。楼增高至十丈。
清康熙十七年,重修佛殿、钟楼,建鼓阁。乾隆十九年,重修佛殿、钟禅悦寺并增造功德堂。清康、乾两朝,是禅悦寺的鼎盛时期,以后逐渐衰败。清咸、同间又遭兵火,至本世纪初,全寺仅剩钟楼、后殿及正殿的一部分。抗战前,在正殿的基础上建房十一间,用作学堂。后亦逐渐破损。建国后全寺只剩剩下钟楼及部分后殿。一九六六年,钟楼也被拆除,现仅剩后殿部分建筑于晨光针织厂内。
禅悦寺不仅位澉浦寺庙之冠,也是全国著名的寺庙之一,特别是钟楼,以其雄伟的建筑、激越悠远的钟声而成为澉浦的标志性的建筑。